磷酸化蛋白质组学

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介绍

1. 技术介绍

根据中心法则,遗传信息从DNA传递到信使核糖核酸,RNA被翻译成蛋白质。但研究表明,组织中的mRNA丰度与蛋白质丰度并不完全一致。因此,基因并不能解释所有的表型,据推测,几乎每种蛋白质都会经历某种形式的蛋白质翻译后修饰(PTM)。

PTM是蛋白质翻译后共价加工的过程,通过在一个或多个氨基酸残基上添加化学基团,可以改变蛋白质的物理化学性质,从而影响蛋白质的空间构象、活性状态、亚细胞定位和蛋白质间的相互作用。已知的翻译后修饰有300多种,但深入研究的很少,常见的几种研究类型包括磷酸化、乙酰化、泛素化、N-糖基化等。其中磷酸化修饰(Phosphorylation)是生物体内最重要的共价修饰方式之一,是目前分布最多、也是最广泛研究的修饰,其发生过程是在激酶(kinase)催化下,将ATP的磷酸根基团转移到蛋白的氨基酸(Ser、Tyr、Thr)侧链上。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程调节着包括细胞增殖、发育、分化、信号转导、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩及肿瘤发生等过程在内的所有生命活动。发生磷酸化修饰的氨基酸上共价连接磷酸基团,其分子质量会增加发生79.97Da。

利用质谱可测定分子量是否发生79.97Da的质量偏移,从而检测磷酸化修饰肽段及位点。真核生物的所有蛋白质中,磷酸化蛋白质的占比约在 1/3 到 2/3 之间,但由于特定位点的磷酸化修饰程度可能从小于 1% 到大于 90% 不等,且通常较低,因此针对磷酸化修饰位点的定量分析一直存在着大的挑战。利用高特异性的分离富集手段,从蛋白质组样品中实现磷酸化蛋白质组的分离富集,可以极大地提高磷酸化蛋白质组的分析深度。

2. 技术优势

PCT处理,高重复性高稳定性
改良IMAC富集,高富集效率,降低样本起始量
TMT分级降低样本复杂性,提升鉴定深度
高灵敏度Exploris 480采集

3. 技术流程

样本收集→ 酶解消化→磷酸化肽段富集 →质谱采集 → 搜库→数据分析

4. 技术应用

肿瘤分子分型
蛋白激酶与药物靶点
神经系统研究

质谱仪

timsTOF Pro Bruker

Orbitrap Exploris 480

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