磷酸化蛋白质组学

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介绍

在众多的蛋白质翻译后修饰 (Post-translational modifications, PTMs) 类型中,磷酸化 (Phosphorylation) 是一类广泛存在的修饰。真核生物的所有蛋白质中,磷酸化蛋白质的占比约在 1/3 到 2/3 之间,但由于特定位点的磷酸化修饰程度可能从小于 1% 到大于 90% 不等,且通常较低,因此针对磷酸化修饰位点的定量分析一直存在着大的挑战。利用高特异性的分离富集手段,从蛋白质组样品中实现磷酸化蛋白质组的分离富集,可以极大地提高磷酸化蛋白质组的分析深度。

结合高特异性的磷酸化蛋白质组分离技术,利用 DIA 技术可实现高保真的,高深度的蛋白质磷酸化修饰谱的绘制和分析。

利用 4D-蛋白质组学技术,结合已有的蛋白质磷酸化修饰组分析策略及方法,可实现 4D-蛋白质磷酸化修饰组的分析,相对于常规技术,得到精度更高的蛋白质磷酸化修饰谱,为相关生物学/医学问题的研究提供技术支持。

应用场景:磷酸化蛋白质组分析

常见的蛋白质翻译后修饰种类

结合TMT标记定量的蛋白质组及磷酸化蛋白质组分析流程

质谱仪

timsTOF Pro Bruker

Orbitrap Exploris 480

参考文献

  1. 1. Robust phosphoproteome enrichment using monodisperse microsphere-based immobilized titanium (IV) ion affinity chromatogra phy. Nature Protocols. 2013
  2. 2. Fishing the PTM proteome with chemical approaches using functional solid phases. Chemical Society Reviews. 2015
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