西湖欧米携蛋白质谱基础模型DIArt亮相2023中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP)

2023.09.18

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2023年8月30-31日,第七届中国计算蛋白质组学研讨会(The 7th China Workshop on Computational Proteomics)在北京举办。

会议邀请了蛋白质组学及相关领域内多位国内外著名专家和教授作大会报告,就质谱数据分析新方法、蛋白质组鉴定与定量新技术、翻译后修饰分析、蛋白质交联与结构解析、蛋白质基因组学、蛋白质芯片、蛋白质组学与深度学习、蛋白质组学助力药物研发等主题进行了演讲和讨论,共同交流蛋白质组学研究工作中的经验与体会,探讨计算蛋白质组学领域的合作与发展。

为期两天的会议中,有26位专家受邀作大会报告(按拼音或英文名字母排序):

曹勇、常乘、陈红莉、陈小华、Francis J. O'Reilly、贾伟、江何伟、李婧、林世贤、刘超、刘凡、刘健慧、Manuel Matzinger、任间、邵文广、孙瑞祥、汪迎春、王洪、闻博、杨靖、叶明亮、于晓波、余风潮、张梦欢、赵倩、钟传奇。

 

会议特邀报告人

8月30日上午九点,西湖大学长聘副教授、西湖欧米创始人郭天南博士代表中国蛋白质组学会致开幕辞。他在致辞中指出,此次CNCP会议的26位特邀报告人既包括若干资深专家,也包括多位年轻 PI 和毕业不久的优秀 PhD,很高兴能看到蛋白组学领域的 “中坚力量” 与 “新鲜力量” 齐聚一堂,共议领域发展。

 

 

作为赞助单位之一,西湖欧米也积极参与到会议之中。30日中午,西湖欧米AI首席科学家陈义博士在会议上分享了蛋白质组基础模型DIArt研究进展。

 

 

陈义博士指出,ChatGPT的横空出世将AI基础模型带入了大众视野。基础模型是近年来AI领域最重要的进展之一,在计算机视觉、语音处理、生命科学及医药健康领域都带来了很多革命性的进展和开创性的探索工作。

在蛋白质组学领域,基础模型为解决标注数据稀缺的任务带来曙光。陈义博士介绍了由西湖欧米和西湖大学蛋白质组大数据实验室共同研发的最新谱图基础模型DIArt。他介绍了DIArt现阶段进展,包括系统界面与整体流程,以及最新的实验结果。目前, DIArt可以实现对DIA数据的深度蛋白鉴定和准确定量,表现超过其他软件。

随后,他分享了DIArt未来改进方向,并介绍了西湖欧米和西湖大学蛋白质组大数据实验室正在开发的交互式蛋白质组大模型 ProtTalks。他表示,这些基于人工智能的新工具都是基础模型在蛋白组学领域的应用展望。在未来,希望人工智能能更好应用于蛋白质组学领域,助力广大研究人员。

 

 

本次 CNCP 会议由中国人类蛋白质组学会(CNHUPO)、中国科学院计算科学研究所、北京航空航天大学、中国科学院上海药物研究所、国家蛋白质科学中心(北京)、北京生命科学研究所、中国科学院大连化学物理研究所联合主办。会议在不同专题下以单进程、高密度报告的形式进行,为蛋白组学领域的研究者提供了优质的学习和交流平台。

CNCP 会议由中国科学院计算技术研究所 pFind 团队牵头发起,致力于推动中国计算蛋白质组学研究,促进国内蛋白质组学领域的学术交流。自 2010 年起,CNCP 会议基本保持两年一届的传统,迄今已成功举办六届。

 

2023 CNCP 与会者大合照

计算蛋白质组学

“计算蛋白质组学”(Computational Proteomics)以计算技术为主要手段,通过开发高效的算法和实用的软件工具来处理大规模蛋白质实验数据并解决蛋白质组学领域中的诸多问题。

随着蛋白质组学的兴起,特别是质谱技术的快速发展,蛋白质组学研究中产生的数据规模越来越大,依靠简单的手工处理已经远远不能满足问题的需求。通过先进的计算机算法与软件工具来自动处理大批量的蛋白质组数据已经成为蛋白质组学研究的重要分支,计算蛋白质组学应运而生。

目前,计算蛋白质组学在蛋白质鉴定和定量、翻译后修饰分析、蛋白质相互作用、蛋白质定位、蛋白质结构和蛋白质动力学等领域中均发挥着重要作用。近年来,在中国蛋白质组学项目驱动下,国内计算蛋白质组学的研究发展迅速,在国际蛋白质组学领域内也声誉渐隆。

 

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