欧米科服show|“膨胀” 的空间蛋白质组学 ProteomEx

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空间蛋白组研究意义

蛋白质作为疾病生物标志物和药物靶点,在生命科学研究中具有举足轻重的作用。蛋白质组描述了细胞、组织或体液中发现的完整蛋白质世界。对于组织样本,传统的蛋白质组检测往往会丢失空间维度的生物信息,使得我们难以解析组织异质性等方面的问题。因此近年来,空间组学应运而生。

ProteomEx 技术详解

西湖欧米推出的ProteomEx(Proteomics+Expansion,可膨胀的蛋白质组技术)空间蛋白质组学是对切片组织中不同区域部位的蛋白质组研究,通过将组织嵌入到可膨胀的水凝胶中,使样品在保持原形态的基础上进行放大(最大放大8倍,相当于体积放大512倍),然后进行精准物理切割,从而切入到高灵敏蛋白质组学实验流程中。
ProteomEx 技术创新优势:
高稳定性膨胀水凝胶 + 高分辨显微成像 + 高灵敏度 4D-DIA,为空间蛋白质组学研究保驾护航。

研究论文

此项工作于2022年11月30日发表于 Nature Communications,题目为 Spatially resolved proteomics via tissue expansion
ProteomEx技术能够以~160μm的横向分辨率(相当于~0.61 nL组织体积)分析组织切片样本的空间异质性。本研究从小鼠的5个不同脑区获取144个含有具体定位信息的样本,共鉴定到6233种蛋白。在老年 AD 小鼠中,海马区差异蛋白最多,进一步解析海马区的亚区域,发现海马 CA1 亚区变化最明显,有198个差异蛋白。这些结果表明ProteomEx空间蛋白质组学技术可以有效地研究阿尔兹海默症的病理异质性。

ProteomEx 空间蛋白组学流程

 

送样建议

1. 样本数量要求:
建议每组5例以上生物学重复,每例样本建议提高1张用于正式实验的染色切片+1张备用的染色切片+2张建库白片。
此外项目同类型组织需提供3张切片用做膨胀测试。
 2. 样本运输要求:

● 干冰运输条件:由于温度不同,干冰挥发程度不同,建议按照5kg/天计算,一般时效性在3天,需要约15-20kg干冰。包装使用冰盒(泡沫盒+干冰+冰袋),打包时先放入足量干冰,之后用冰袋填充泡沫盒中间的空隙。天气较为炎热时,建议采用厚一点的泡沫盒,以及多增加干冰;

● 传染性/感染性样本:需提供灭活证明,灭活后在西湖欧米P2实验室开展实验。
 3. 其他要求:
送样前请提前沟通染色方法,支持HE、考马斯亮蓝、免疫组化等绝大部分染色方法。如客户自行染色的,请按送样要求切片后进行相应染色及拍片成像,再将染色好的切片样本直接寄送至西湖欧米,或联系销售取样。

目前项目经验

截至目前,西湖欧米已处理过肺、脑、肝、胰腺、子宫内膜、晶状体、骨头、前列腺、唇腺等组织样本类型。

 

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西湖欧米致力于以蛋白质组大数据技术创新为驱动力,联合AI多模态大数据分析,助力精准医学和药物研发,已经拥有多项国家专利和计算机软件著作权。西湖欧米目前已与百余家国内外知名高校及科研院所、医院、药企等建立了合作,并在国际顶级期刊CellNature MedicineCell Discovery 等发表了多篇高质量蛋白组学研究合作成果。

 

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