突破限制 | OmniProt深度血液蛋白组新品发布

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血液蛋白质组学研究充满挑战

血液是一种易于获取但又涵盖了大量生物学密码的临床样本。在临床蛋白质组学的逐渐蓬勃发展过程中,研究者利用血液蛋白质组学这一方法在推动疾病特异性生物标志物、疾病发生发展机制等研究中发挥了巨大的作用。

然而,血液蛋白质组学研究充满了挑战性。血液蛋白含量差异大,分布极为不均,高丰度蛋白占据几乎99%以上,追溯早前的研究可发现该领域进展相当有限,如1994-2002年期间血液蛋白质鉴定量仅为200+。直至近几年,血液蛋白质组开始大力发展,其鉴定量目前通常在几百到一千多。

2002年,仅能检测到289种蛋白质[1]

蛋白丰度越低,研究越少[2]

蛋白质组学研究的策略,通常是希望先尽可能发现较多的蛋白,从中挑选出有意义的biomarker后再进行相关的验证工作。

蛋白组学研究策略[3]

因此,亟需解决的第一步,是如何增加血浆中蛋白的检出?2002年,人类血浆蛋白质组计划HPPP(Human Plasma Proteome Project)启动,旨在解决血浆蛋白质组学中的主要挑战如灵敏度和分析深度等。近几年,随着技术发展,血液蛋白质组研究有了较大的进步。

目前HPPP中人血浆肽谱图数量

♦ 新品发布:OmniProt 高深度血液蛋白组来袭 

西湖欧米自成立以来,承接了诸多临床血液蛋白质组项目。目前,实测4个batch TMT检测总蛋白鉴定量高至2900+,单Batch蛋白鉴定量平均能达2500+。经团队潜心研发,现正式推出OmniProt深度血液蛋白质组服务,蛋白检出率显著提升!

化学微粒式富集血液中的中低丰度蛋白[4]

团队采用特色化学微粒式富集血液中的中低丰度蛋白,高深度TMT方法进行上机检测,目前,TMT单Batch蛋白鉴定量平均能达2500+,实测4个batch TMT检测总蛋白鉴定量高至2900+。当血液中蛋白含量增加时,我们发现OmniProt带来的中低丰度蛋白含量占比>95%以上。因此,我们可从中发现更多的差异蛋白。

◊人血液项目升级前 vs 升级后蛋白鉴定数对比

◊OmniProt TMT技术重复相关性>0.9

OmniProt-TMT 批次内和批次间CV的中位数<0.1

◊ OmniProt法 不同实验分组的无监督聚类分析优异

OmniProt法 数据整体表达及整体聚类优异(未筛选)

OmniProt,带来的不仅仅是血液中蛋白数目的增多,而且更是在疾病探索中作为一个有力的工具,能够发现更多有意义的之前 “不被看见” 的蛋白。

新品尝鲜

新品推出,诚意满满,西湖欧米希望以OmniProt为助推器,尽可能抓住血液中更多的蛋白,为各位老师的研究保驾护航。

西湖欧米部分血液蛋白组客户文章

参考文献:
[1] Anderson NL, Anderson NG. The human plasma proteome: history, character, and diagnostic prospects. Mol Cell Proteomics. 2002 Nov;1(11):845-67.
[2] Ignjatovic V, Geyer PE, Palaniappan KK, et al. Mass Spectrometry-Based Plasma Proteomics: Considerations from Sample Collection to Achieving Translational Data. J Proteome Res. 2019 Dec 6;18(12):4085-4097.
[3] Geyer P E, et al. Revisiting biomarker discovery by plasma proteomics[J]. Molecular systems biology, 2017, 13(9): 942.
[4]Liu Y, Wang J, Xiong Q,  et al. Nano-Bio Interactions in Cancer: From Therapeutics Delivery to Early Detection. Acc Chem Res. 2021 Jan 19;54(2):291-301.

血液蛋白质组学研究充满挑战

血液是一种易于获取但又涵盖了大量生物学密码的临床样本。在临床蛋白质组学的逐渐蓬勃发展过程中,研究者利用血液蛋白质组学这一方法在推动疾病特异性生物标志物、疾病发生发展机制等研究中发挥了巨大的作用。

然而,血液蛋白质组学研究充满了挑战性。血液蛋白含量差异大,分布极为不均,高丰度蛋白占据几乎99%以上,追溯早前的研究可发现该领域进展相当有限,如1994-2002年期间血液蛋白质鉴定量仅为200+。直至近几年,血液蛋白质组开始大力发展,其鉴定量目前通常在几百到一千多。

2002年,仅能检测到289种蛋白质[1]

蛋白丰度越低,研究越少[2]

蛋白质组学研究的策略,通常是希望先尽可能发现较多的蛋白,从中挑选出有意义的biomarker后再进行相关的验证工作。

蛋白组学研究策略[3]

因此,亟需解决的第一步,是如何增加血浆中蛋白的检出?2002年,人类血浆蛋白质组计划HPPP(Human Plasma Proteome Project)启动,旨在解决血浆蛋白质组学中的主要挑战如灵敏度和分析深度等。近几年,随着技术发展,血液蛋白质组研究有了较大的进步。

目前HPPP中人血浆肽谱图数量

♦ 新品发布:OmniProt 高深度血液蛋白组来袭 

西湖欧米自成立以来,承接了诸多临床血液蛋白质组项目。目前,实测4个batch TMT检测总蛋白鉴定量高至2900+,单Batch蛋白鉴定量平均能达2500+。经团队潜心研发,现正式推出OmniProt深度血液蛋白质组服务,蛋白检出率显著提升!

化学微粒式富集血液中的中低丰度蛋白[4]

团队采用特色化学微粒式富集血液中的中低丰度蛋白,高深度TMT方法进行上机检测,目前,TMT单Batch蛋白鉴定量平均能达2500+,实测4个batch TMT检测总蛋白鉴定量高至2900+。当血液中蛋白含量增加时,我们发现OmniProt带来的中低丰度蛋白含量占比>95%以上。因此,我们可从中发现更多的差异蛋白。

◊人血液项目升级前 vs 升级后蛋白鉴定数对比

◊OmniProt TMT技术重复相关性>0.9

OmniProt-TMT 批次内和批次间CV的中位数<0.1

◊ OmniProt法 不同实验分组的无监督聚类分析优异

OmniProt法 数据整体表达及整体聚类优异(未筛选)

OmniProt,带来的不仅仅是血液中蛋白数目的增多,而且更是在疾病探索中作为一个有力的工具,能够发现更多有意义的之前 “不被看见” 的蛋白。

新品尝鲜

新品推出,诚意满满,西湖欧米希望以OmniProt为助推器,尽可能抓住血液中更多的蛋白,为各位老师的研究保驾护航。

西湖欧米部分血液蛋白组客户文章

参考文献:
[1] Anderson NL, Anderson NG. The human plasma proteome: history, character, and diagnostic prospects. Mol Cell Proteomics. 2002 Nov;1(11):845-67.
[2] Ignjatovic V, Geyer PE, Palaniappan KK, et al. Mass Spectrometry-Based Plasma Proteomics: Considerations from Sample Collection to Achieving Translational Data. J Proteome Res. 2019 Dec 6;18(12):4085-4097.
[3] Geyer P E, et al. Revisiting biomarker discovery by plasma proteomics[J]. Molecular systems biology, 2017, 13(9): 942.
[4]Liu Y, Wang J, Xiong Q,  et al. Nano-Bio Interactions in Cancer: From Therapeutics Delivery to Early Detection. Acc Chem Res. 2021 Jan 19;54(2):291-301.
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