西湖欧米个性化作图套餐

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在蛋白质组学研究中,从样本前处理,上机检测到后续的数据挖掘,都是环环相扣的过程。西湖欧米持续为客户提供高质量的蛋白质组学服务,在数据挖掘方面,为客户提供多种多样性的展示图以及严谨的生信分析方案设计。

针对西湖欧米生信套餐包中组图的部分单图,客户可在西湖欧米“糖果铺”中挑选不同的展现形式、不同的颜色搭配,以此来升级分析图的展示。

 

火山图  Volcano

火山图在转录、蛋白、代谢等组学研究中用于总览数据分布情况、可视化差异数据。

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热图  Heatmap

热图是一种数据可视化技术,通常用于呈现高维数据的结构和相互关系,以及在不同条件或时间点下的变化。热图的主要特点是使用颜色来表示数据的大小或相对大小,可以有效地展示大量的数据。

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物种多样性图

描述菌群在不同实验中的多样性包括alpha多样性与beta多样性,Alpha-生物多样性是反映丰富度和均匀度的综合指标,常用的指数包括Shannon指数(来源于信息熵的概念,值越大,说明系统混乱程度越高,即群落多样性越高)、Simpson指数(反映群落中优势种的地位和作用,若一个群落中优势种占比多,其他非优势物种占比少,则Simpson指数较大,该群落多样性较低);β-生物多样性侧重比较不同群落之间的区别,即分组间是否具有显著的微生物群落差异,包含NMDS 、 adonis 等分析, NMDS侧重反映距离矩阵中数值的排序关系,弱化数值的绝对差异程度。

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GSEA图

GSEA不依赖预定义的基因列表(一般指差异基因),而是使用整个基因表达数据集。它通过对基因排序和富集得分的计算,能够全面考察基因集的富集情况,并区分富集在基因表达上调或下调的基因集。

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